Cause And Effect——如果说「Appleseed」是“因”，那么「攻壳机动队SAC 2nd GIG」就是“果”。 1999年，欧共体与亚洲各国，特别是与中国、韩国、日本间的摩擦加剧。当欧洲和美国在第三次世界大战战场上疲于奔命的时候，东亚地区因为没有战事而积累了大量财富，几乎成为唯一的战争受益者。这种不平衡也使得亚洲在不知不觉中成了世界的敌人。欧共体-美国结为同盟，向亚洲宣战。第四次世界大战爆发。最后时刻中国的加入使这场拉锯战以亚洲的胜利告终。虽然双方在战场上小心翼翼地避免核武的再次使用，但都极尽所能地派上了所有常规武器，电子脑、Cyborg等新技术也被大胆投入实战，从而使这场战争陷入了相当长时间的胶着状态。最终，战争的泥潭吞没了双方，谁都抽身不能。20世纪60年代，美国曾在越南饱尝这种滋味，因此，第四次世界大战又被称为“第二次越南战争”。 事实上，两次大战对于在经济上已经疲态尽现的日本来说是个契机。使用了核武器的第三次大战将整个地球拖向了崩溃的边缘，人们迫切想找到一个补救措施来使失衡的世界恢复元气，“波塞冬”，即大日本技研，作为超新星出现在了残破不堪的T型台上。尽管在战争中没有捞到任何好处，但它在战时研发出的携带嵌入式自繁殖功能的纳米机械人，在战后被大量用于去除核战造成的放射能粉尘。凭借毫微级的不断积累，这个表面上独立于政府，却与猎户座集团有着千丝万缕微妙联系的机构逐渐拥有了雄厚的财力，而其向政界渗透的动机也日渐明朗。核战前，日本在经济上的优势已不再突出，更遑论在国际事务中的影响力；战后，大日本技研的分子工学机器人产品创造了“日本奇迹”，使经济全线复苏，；尽管参与了第四次非核战争，但亚洲的胜利最终使这个国家的国际地位上升到了一个新的高度。同时，随着“二次越战”后地球上原有区域逐渐统一，人口的分布也不再像从前那样受地域限制，而是以更加自由的方式流动，此时的日本也以相对突出的经济优势及战后民主主义吸引了大批外来人口，统称为“难民”。大批涌入的难民虽然给日本带来了廉价劳动力，但同时也造成了部分国民的恐慌，他们担心政府无节制的难民收容政策将给社会造成财政危机，给本国国民带来更大的就业压力，简单说，就是自己的饭碗端得更不牢靠了。这种情绪在某种势力的操控下，很快在普通人群中蔓延，最终形成了对政府的不信任和群体恐慌，“这个国家为了在国际上装好人，在救助问题上表现得大度、收容难民的代价，最后还是要纳税人承担”（攻壳机动队SAC 2nd GIG第一话）的看法被普遍接受。同时，不正当的电子脑和义体的交易与使用也使得战后思想动荡，伦理道德的底线再次被漠视和践踏。人们整体渴望真相，也害怕接受真相，于是，一个被创造的代言群体——“个别的11人”，还有它的半个造物主，也是“日本奇迹”的创造者之一的合田一人现身于那条无源的锁链上。 起初，一切的背后包括“日本奇迹”，都有猎户座集团在支持。技术与管理上的逐渐成熟使大日本技研不再满足于单纯的领命状态，转而向上层建筑看齐。“波塞冬”对自己的能力所及有万分把握，既往高层官僚掌握的电子脑和义体专有权记录就是他们的直通车。2130年，随着“苹果核”计划正式向世人公开，大日本技研也依靠出口高科技产品和高明的商业技巧与各个政治团体建立了关系，从此，这个由巨大的海上都市群构成的企业联合国家一跃成为一股不容小觑的新兴势力。
